Лаборатория молекулярно-генетических исследований

Заведующая лабораторией


Гориславец Светлана Михайловна

кандидат биологических наук

Тел.: +7 (978) 923-1194
Email: MGR.Magarach@gmail.com

Сотрудники лаборатории


Рисованная Валентина Ивановна

ведущий научный сотрудник

кандидат биологических наук, доцент

 

 

 

Володин Виталий Александрович

младший научный сотрудник

кандидат сельскохозяйственных наук

 

 

 

Колосова Аделина Александровна

младший научный сотрудник

 

 

 

О лаборатории
Лаборатория молекулярно-генетических исследований была образована в 2006 году в рамках международных проектов (IPGRI), на основе группы биохимической генетики, существующей в Институте виноградарства и виноделия «Магарач» с 1989 года.

Основные направления исследований:

Развитие и внедрение геномных и постгеномных технологий в виноградарстве:
 — молекулярно-генетическая идентификация и паспортизация существующих сортов, гибридов и дикорастущего винограда в рамках генотипирования мировых растительных ресурсов. Новые классы молекулярных маркеров и методы маркирования генома;
 — молекулярная диагностика и идентификация трудно определяемых и не определяемых традиционными методами вирусных, фитоплазменных, бактериальных и грибных фитопатогенов и их векторов;
 — применение технологии Real-time PCR для оценки уровня экспрессии гена (количественное содержание фитопатогенов). Детекция вирусов, бактерий, грибов и микроорганизмов;
   —    использование технологии секвенирования;
 — технология ДНК маркирования для выделения доноров устойчивости к повреждающим абиотическим и биотическим факторам среды и ценных признаков (MAS);
 — характеристика биологического разнообразия аборигенных и диких форм винограда, на основе анализа микросателлитных локусов, как важнейшего ресурса зародышевой плазмы Крыма.

Основные объекты исследований:

Виноград: сорта, клоны, гибриды, подвои, дикорастущий виноград, фитопатогены винограда и плодовых (яблоня) разной этиологии.

Основные научные достижения

«Генотипирование сортов винограда рода Vitis L. коллекции зародышевой плазмы и оценка уровня аллельного полиморфизма микросателлитных локусов на основе мультиплексного фрагментного анализа».
В результате научно-исследовательской работы достигнуты следующие результаты:
• генотипирование аборигенных сортов винограда, поддерживаемых в ампелографической коллекции института «Магарач», на основе анализа методом SSR — ПЦР ядерных (nSSR) и хлоропластных (cpSSR) микросателлитных локусов для оценки генетического разнообразия, уточнения филогении и выявления сортов-синонимов
• По результатам ДНК-фингерпринтинга генотипов и гаплотипов, впервые, на молекулярно-генетическом уровне, установлено степень генетического родства уникальных крымских технических сортов винограда Эким кара, Кефесия, Крона и Джеват кара, сортов винограда Манжил ал, Шабаш и Шабаш крупноягодный, Бияс айбатлы, Богос зерва, Хачадор, Полковник изюм,
• генотипирование сортов винограда селекции института «Магарач» на основе анализа аллельного полиморфизма SSR локусов.

наследование аллелей родитель-потомок у селекционных сортов Антей магарачский (родитель) и Гранатовый Магарача (потомок)


• Проводятся исследования биологического разнообразия дикорастущего винограда Vitaceae Juss., как важнейшего ресурса зародышевой плазмы винограда Крыма на основе анализа микросателлитных локусов.
• Выполнены широкомасштабные исследования по молекулярной диагностике фитопатогенов, актуальных для сельского хозяйства Крыма. В течении трёх лет в разных регионах Крыма выполнялись фитосанитарные исследования виноградных насаждений на молекулярно-генетическом уровне. Разработаны, совместно с ФИЦ «Биотехнологии» РАН, базы данных о распространении в Крыму фитопатогенов разной этиологии (получены Свидетельства о государственной регистрации № 2016620355 и 2016621117): «Распространение вирусных фитопатогенов винограда Vitis vinifera L. на территории Крыма (база данных)»

«Распространение бактериальных фитопатогенов винограда Vitis vinifera L. на территории Крыма (база данных)»

• На базе лаборатории выполняются научные исследования по диагностике латентной формы вирусных, бактериальных и фитоплазменных инфекций и их векторов микробиологическим методом и методами ПЦР:
1. Основные вирусные инфекции
GFLV Grapevine fan leaf virus, короткоузлие винограда
Комплекс «скручивание листьев винограда», штаммы:
GLRaV-1 Grapevine leafroll-associated virus 1
GLRaV-2 Grapevine leafroll-associated virus 2
GLRaV-3 Grapevine leafroll-associated virus 3
GFkV Grapevine fleck virus, вирус мраморной мозаики
ArMV Arabis mosaic virus, вирус арабской мозаики винограда
Комплекс бороздчатости древесины RWC:
GVA Grapevine virus A – опробковение коры винограда
GVB Grapevine virus B – ямчатость древесины винограда
RSPaV — Rupestris stem pitting-associated virus — бороздчатости древесины Rupestris
ApMV Apple mosaic virus — вирус мозаики яблони
ACLSV Apple chlorotic leafspot virus — вирус хлоротичной пятнистости яблони
ASGV Apple stem grooving virus — вирус бороздчатости древесины яблони
ASPV Apple stem pitting virus — вирус ямчатости древесины яблони


2. Бактериальные инфекции:
Agrobacterium spp. – бактериальный рак (в растительном материале и почве):
Agrobacterium tumefaciens
Agrobacterium vitis
Agrobacterium rhizogenus
Xylophilus ampelinus — бактериальный некроз (увядание)
Erwinia amylovora – бактериальный ожёг плодовых
Фитоплазма – Почернение древесины bois noir
Золотистое пожелтение винограда Grapevine yellows (Flavescence doree)

1-4 Получение накопительных культур (микробиологический метод)
5 Тест на патогенность
6 Тестирование латентной формы бактериальных болезней (метод гель-электрофореза)

Гранты, проекты:

РФФИ № 15-29-02715: «Характеристика биологического разнообразия аборигенных и диких форм Vitaceae Juss. на основе анализа микросателлитных локусов, как важнейшего ресурса зародышевой плазмы (генофонда) растительности Крыма».
«Молекулярная диагностика фитопатогенов винограда, актуальных для сельского хозяйства Крыма» № RFMEFI60414X014 с Министерством образования и науки РФ (2014-2016 гг.).
Cost action FA1003: “East-West collaboration for conservation and sustainable use of grapevine genetic resources from the Caucasus region” (2010-2014).
ECO-NET Project: «Genetic resources of cultivated and wild grapevine: identification, characterisation, evaluation, and exploitation of old varieties and wild genotypes» (2006-2007).
IPGRI Project: “Conservation and Sustainable Use of Grapevine Genetic Resources in the Caucasus and the Northern Black Sea Region” (2004-2006).
Международный двусторонний проект с Молдавией № М/172-2004: «Оценка генетической специфичности сортов винограда украинской и молдавской селекции” (2004-2005).
Международный двусторонний проект с Критским университетом (Греция) № 2М/170-2001: “Development of a multimedia web- backed genetic database for Ukrainian and Moldavian germplasm of Vitis vinifera ” (2001-2003).
International research of grape chloroplast genome polymorphisms in the Mediterranean area with Departamento de Genética Molecular de Plantas, Centro Nacional de Biotecnologia,CSIC, Spain (2001).

Стажировки: Критский университет, лаборатория биотехнологии и физиологии (Греция); Центр государственных исследований, лаборатория биотехнологии (Люксембург), Институт агрономических исследований (INRA) лаборатория «Разнообразие и геном» (Франция).

Научное сотрудничество лаборатории молекулярно-генетических исследований в рамках международных проектов

Коллекция винограда института INRA (Франция)

Основные публикации сотрудников лаборатории

1. Гориславец, С.М., Рисованная В.И. / Влияния 2,4-Д, НУК, БАП на индукцию ризогенеза и каллусообразования в первичном каллусе двух сортов винограда // Бюллетень Государственного Никитского Ботанического сада, Ялта, 2004. — Вып. 89. — С. 44-47
2. Arroyo-Garcia, R., RuizGarcia, L., Bolling, L., Ocete, R., Lopez, M.A., V. Risovannaya, S. Gorislavets et al. / Multipl origins of cultivated grapevine (Vitis vinifera L. ssp. Sativa) based on chloroplast DNA polymorphisms // Molecular Ecology.2006.V. 15. P. 3707-3714.
3. С.М.Гориславец, В.И. Рисованная /Оценка стабильности генотипов винограда по микросателлитным локусам при длительном культивировании in vitro //Агроекологічний журнал. Спеціальній випуск. 2008.  Київ.  С. 67-69.
4. Гориславец С., Рисованная В., Шелудько Ю. / Анализ окрашенных технических сортов винограда по антоциановым профилям экстрактов ягод и каллусных культур // Экосистемы Крыма, их охрана и оптимизация.  Симферополь.  2008.  Вып. 18.  C. 66-72.
5. С.М. Гориславец, В.И. Рисованная / Оценка стабильности генотипов винограда по микросателлитным локусам при длительном культивировании in vitro //Агроекологічний журнал. Спеціальній випуск. 2008.  Київ.  С. 67-69.
6. Гориславец С., Рисованная В., Шелудько Ю. / Анализ окрашенных технических сортов винограда по антоциановым профилям экстрактов ягод и каллусных культур // Экосистемы Крыма, их охрана и оптимизация.  Симферополь.  2008.  Вып. 18.  C. 66-72.
7. Heuertz M., Goryslavets S., Hausman J.F., Risovanna V. / Characterization of grapevine accessions from Ukraine using microsatellite markers. //American Journal of Enology and Viticulture.2008. 59.  P. 169-178.
8. D. Maghradze ,S. Gorislavets, E. Maul , G. Melyan, V. Risovanaya, et al. / Conservation and Sustainable Use of Grapevine Genetic Resources the Caucasus and Northern Black Sea Region. // ISHS Acta Horticulturae. 2009. V. 827. P. 155-158.
9. S. Goryslavets, V. Risovanna, R. Bacilieri, J.F. Hausman, and M. Heuertz /A Parentage Study of Closely Related Ukrainian Wine Grape Varieties using Microsatellite Markers // Cytology and Genetics. 2010. Vol. 44. №.2. P. 95–102.
10. Гориславец С.М., Рисованная В.И., Виноградов Б.А./ Хроматомасс-спектрометрическое определение содержания летучих веществ в соке крымских аборигенных сортов винограда // Магарач. Виноградарство и виноделие.  2011.  № 4.  С. 13-15.
11. Рисованная В.И., Гориславец С.М. / Молекулярно-генетические маркеры в селекции винограда. // Научные труды ГНУ СКЗНИИСиВ.- Краснодар.- 2013 .- Том 1. — С. 174-180.
12. Рисованная В.И., Гориславец С.М., Володин В.А. / Тестирование латентной стадии фитоплазменной инфекции винограда // Магарач. Виноградарство и виноделие.  2013.  № 4.  С. 6-8.
13. L. Rustioni , G. Cola , S. Fiori , O. Failla , R. Bacilieri , E. Maul , J.E. Eiras Dias , J. Brazao , L. Kocsis , F. Lorenzini , D. Maghradze , R. Chipashvili , E. Maletic , D. Preiner , D. Molitor , N. Muljukina , G. Munoz-Organero , M. Musayev, N. Nikolaou , V. Risovanna et al. / «Application of Standard Methods for the Grapevine (Vitis vinifera L.) Phenotypic Diversity Exploration: Phenological Traits» 2014. //Proc. I IS on Fruit Culture and Its Traditional Knowledge along Silk Road Countries Ed.: D. Avanzato Acta Hort. 1032, ISHS. – 253-260.
14. L. Rustioni, D. Maghradze, C.F. Popescu, G. Cola, E. Abashidze, J. Brazão, S. Coletti, V. Cornea, L. Dejeu, D. Dinu, J.E. Eiras Dias, S. Fiori, S. Goryslavets, V. Risovanna et al. / First results of the European grapevine collections’ collaborative network: validation of a standard eno-carpological phenotyping method // Proc. I IS on Fruit Culture and Its Traditional Knowledge along Silk Road Countries Ed.: D. Avanzato Acta Hort. 1032, ISHS, 2014. – 253-260.
15. В. Рисованная, С. Гориславец / Полиморфизм аллелей микросателлитных локусов в генотипах молдавских аборигенных сортов винограда с ампелографической коллекции «Магарач» // Materiale Simpozionului Ştiinfic International “Horticultura modernă – realizări şi perspective” delicat aniversării a 75 de ani de la fondarea Facultăţii de Horticultură a Universităţii Agrare de Stat din Moldova. 1-2 octombrie 2015. – Vol.42 (2). – Chişinău: UASM (“Print-Caro), 2015. – Р. – 208-211.
16. S. Goryslavets., R.Bacilieri, V.Risovannaya, E. Memetova, V.Laucou / Genetic diversity of ancient grape cultivars of the Crimea region // Vitis (Special issue). — Vol.54. – P. 37-41.
17. С.М.Гориславец, Э.Ш.Меметова, В.И. Рисованная / ДНК профилирование сортов винограда Манжил ал, Шабаш и Шабаш крупноягодный и уточнение их генетических взаимосвязей на основе анализа микросателлитных локусов // Магарач. Виноградарство и виноделие. – 2015. – 3. – С. 17-18.
18. E.Maul, R.Topfer, F.Carka, V.Cornea, S.Goryslavets, V.Risovanna et al. /Identification and characterization of grapevine genetic resources maintained in Eastern European Collections// Vitis (Special issue). — Vol.54. – P. 5-12.
19. Е.В. Поротикова, В.И. Рисованная, Я.А. Волков, Ю.Д. Дмитренко, В.А. Володин, С.М. Гориславец, А.А. Аграновский, А.М. Камионская, С.В. Виноградова / Распространение вирусов скручивания листьев винограда-1 и -3 (grapevine leafroll-associated viruses-1 и -3) на территории Крыма //Вестник Московского Университета. Сер.16.Биология.2016. №2.- С.13-15.
20. E. V. Porotikova, U. D. Dmitrenko, V. A. Volodin, Y. A. Volkov, S. M. Gorislavets, E. P. Stranishevskaya, V. I. Risovannaya, A. M. Kamionskaya and S. V. Vinogradova / First Report of Grapevine virus A in Russian Grapevine // Plant Disease. – 2016, V.100, Number 12. – P. 2541 http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-06-16-0804-PDN
21. U. D. Dmitrenko, E. V. Porotikova, S. M. Gorislavets, V. I. Risovannaya, Y. A. Volkov, E. P. Stranishevskaya, A. M. Kamionskaya and S. V. Vinogradova / First Report of Grapevine rupestris stem pitting-associated virus in Russia // Plant Disease. – 2016, V.100, Number 12. – P. 2542 http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-06-16-0805-PDN
22. E. V. Porotikova, V. I. Risovannaya, Y. A. Volkov, U. D. Dmitrenko, V. A. Volodin, S. M. Gorislavets, E. P. Stranishevskaya, A. A. Agranovsky, A. M. Kamionskaya, and S. V. Vinogradova / Occurrence of Grapevine Leafroll-Associated Viruses-1 and -3 in Crimea // Vestnik Moskovskogo Universiteta. Biologiya. — 2016, N 2, — P. 13–16.
23. Porotikova E. V. , Dmitrenko U. D. , Atapina E. E. , Volkov Y. A., Risovannaya V. I. , Stranishevskaya E. P. , Gorislavets S. M. , Kamionskaya A. M. and Vinogradova S.V. / First Report of the Bacterial Leaf Spot Caused by Pseudomonas syringae on Grapevine (Vitis vinifera) in Russia // Plant Disease. – 2017, V.101, N.2. – P.380. http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-07-16-1040-PDN
24. Volodin, V.A., S.M. Gorislavets, Risovannaya V.I. / Analysis of aboriginal varieties Ekim Kara, Kefessia, Gevat Kara and Krona by morphometric parameters of the leaf and microsatellite loci // Systems Biology and Bioinformatics The Ninth International Young Scientists School SBB-2017. Abstracts. Compilers: О. Petrovskaya, Y. Orlov, S. Zubova. 2017. С. 76.
25. Gorislavets S.М., V.А. Volodin, Y.A. Volkov, А. А. Kolosova, Е.P. Stranishevskaya and V.I. Risovannaya / Genetic diversity assessment of Crimean wild grape forms based on microsatellites polymorphism //Acta Horticulturae (in press).

 

 

ru / en